Interventor de la Asociación del Fútbol Argentino —designado por el gobierno de facto del general Juan Carlos Onganía— desde 1969 y hasta 1971, organismo al que arribó sucediendo a Oscar Ferrari. Bajo su mandato se creó el comité de la AFA para a la organización del Mundial 1978, que él mismo presidió, acompañado por Martín Benito Noel en la vicepresidencia.
Juan Martín Onego Gaona implantó la Selección estable,con Scopelli-Pizzuti-Bravo en el cuerpo técnico. Renunció a la conducción de la casa mayor del fútbol, en junio de 1971.
